More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1261 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1261  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
402 aa  824    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  51.98 
 
 
380 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1689  glycosyl transferase, group 1  38.66 
 
 
381 aa  239  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1683  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 
385 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0725  glycosyl transferase, group 1  31.09 
 
 
382 aa  150  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
372 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
370 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
371 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
395 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  32 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
340 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 
381 aa  87  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 
398 aa  86.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
380 aa  86.3  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  24.35 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5878  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0821211  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  23.92 
 
 
374 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.9 
 
 
371 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0772  glycosyl transferase group 1  26.19 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 
383 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0761  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
349 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.082681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  23.87 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 
382 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  26.32 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  25.63 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
393 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1991  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000239658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  24.03 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.35 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1409  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  25.75 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  25.75 
 
 
372 aa  79  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0824  glycosyl transferase group 1 protein  28.12 
 
 
361 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  26.59 
 
 
386 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  24.56 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2183  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.94 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.94 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0648  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.94 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586366  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.94 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.94 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1544  mannosyltransferase, putative  25 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  31.36 
 
 
381 aa  77.4  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  34.68 
 
 
377 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 
385 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  24.34 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5498  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  32.77 
 
 
435 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  32.42 
 
 
385 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  27.32 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  22.88 
 
 
355 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  22.25 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  27.35 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  30.16 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  28.53 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  25.08 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  40.2 
 
 
1089 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  27.85 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  39.09 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  30.65 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  27.85 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  26.43 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  25.44 
 
 
336 aa  73.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  25.54 
 
 
413 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  29.47 
 
 
382 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  30.48 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4100  glycosyl transferase group 1  24 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17338  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  27.6 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 
384 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  25.94 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  23.27 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3625  glycosyl transferase, group 1  24.54 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  21.4 
 
 
381 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  25.51 
 
 
400 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0326  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>