More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5709 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  85.66 
 
 
727 aa  1251    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  66.62 
 
 
741 aa  989    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  61.54 
 
 
748 aa  840    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  53.65 
 
 
751 aa  763    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  56.03 
 
 
878 aa  811    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  54.07 
 
 
886 aa  785    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  59.95 
 
 
744 aa  854    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  51.03 
 
 
730 aa  705    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  49.66 
 
 
746 aa  699    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  61.93 
 
 
755 aa  876    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  54.94 
 
 
722 aa  763    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  60.7 
 
 
743 aa  893    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  100 
 
 
730 aa  1488    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  54.76 
 
 
883 aa  777    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  85.85 
 
 
723 aa  1253    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  86.27 
 
 
723 aa  1271    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  59.23 
 
 
727 aa  877    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  54.07 
 
 
886 aa  785    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  47.7 
 
 
871 aa  641    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  36.13 
 
 
894 aa  471  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  39.59 
 
 
875 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  38.39 
 
 
861 aa  452  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  38.78 
 
 
879 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  38.53 
 
 
861 aa  452  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  37.78 
 
 
858 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  38.06 
 
 
896 aa  444  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  37.7 
 
 
885 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  40.29 
 
 
865 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  37.57 
 
 
856 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  35.24 
 
 
882 aa  442  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  40.33 
 
 
861 aa  439  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  40 
 
 
862 aa  435  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  39.55 
 
 
855 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  37.55 
 
 
856 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  35.21 
 
 
877 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  35.34 
 
 
877 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  34.92 
 
 
895 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  35.25 
 
 
876 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  40.03 
 
 
890 aa  428  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  37.01 
 
 
894 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  37.28 
 
 
914 aa  425  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  35.29 
 
 
879 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  34.11 
 
 
893 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  38.77 
 
 
856 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  37.15 
 
 
908 aa  422  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  34.69 
 
 
902 aa  419  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  39.49 
 
 
855 aa  416  1e-114  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  39.94 
 
 
872 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  37.46 
 
 
857 aa  412  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  35.16 
 
 
901 aa  412  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  36.98 
 
 
910 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  34.12 
 
 
906 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  37.64 
 
 
856 aa  405  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  34.85 
 
 
900 aa  397  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  36.78 
 
 
881 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  38.87 
 
 
855 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  38.87 
 
 
855 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  33.29 
 
 
887 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  33.78 
 
 
918 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  34.06 
 
 
939 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  30.31 
 
 
874 aa  345  1e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  29.87 
 
 
874 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0612  Glutathione synthase  27.7 
 
 
622 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.42975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0335  cyanophycin synthetase  29.67 
 
 
636 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.609672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4446  Glutathione synthase  29.71 
 
 
637 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  32.04 
 
 
664 aa  157  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  25.46 
 
 
646 aa  150  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0949  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  26.13 
 
 
573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.65 
 
 
778 aa  147  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.31 
 
 
778 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
593 aa  144  9e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0982  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like  29.66 
 
 
1086 aa  142  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.64725  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0172  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.21 
 
 
755 aa  142  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  34.89 
 
 
328 aa  142  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0244  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  33.21 
 
 
755 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1972  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  33.55 
 
 
594 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0840229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0947  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzyme-like  29.02 
 
 
647 aa  135  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
1103 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
593 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  30.88 
 
 
757 aa  127  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1379  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  31.75 
 
 
754 aa  122  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.955263  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
588 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  30.21 
 
 
571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  30.21 
 
 
569 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0257  cyanophycin synthetase-like  30.16 
 
 
333 aa  117  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000601246  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
594 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0096  hypothetical protein  25.23 
 
 
441 aa  116  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.284212  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
594 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 
594 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  31.5 
 
 
578 aa  114  9e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  30.18 
 
 
585 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  29.5 
 
 
579 aa  113  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  28.92 
 
 
584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  30.28 
 
 
585 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  29.74 
 
 
588 aa  111  5e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3472  glutathione synthase  29.76 
 
 
328 aa  111  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.680273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1821  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  29.21 
 
 
750 aa  110  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0432982  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  26.39 
 
 
597 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0527  Mur ligase middle domain protein  23.67 
 
 
741 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000448446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  27.98 
 
 
572 aa  107  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>