More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3365 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3365  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 436 aa  841    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.139638  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  74.56 
 
 		 412 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  74.56 
 
 		 412 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1867  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  77.61 
 
 		 406 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.960562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2897  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  72.42 
 
 		 396 aa  537  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151649  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  59.43 
 
 		 403 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  55.84 
 
 		 399 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  55.84 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  60.57 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  57.3 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1401  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  58.12 
 
 		 403 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1358  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  57.87 
 
 		 403 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24271  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  53.81 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4241  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.11 
 
 		 396 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.122316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  41.25 
 
 		 426 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.15 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.23 
 
 		 414 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  41.01 
 
 		 407 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.25 
 
 		 411 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.34 
 
 		 412 aa  248  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.82 
 
 		 412 aa  246  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  42.78 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.93 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.78 
 
 		 393 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_011989  Avi_3518  MFS permease  39.21 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.01 
 
 		 393 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.24 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  41.24 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.15 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  40.62 
 
 		 398 aa  237  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0749  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.91 
 
 		 498 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471391  normal  0.544805 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  41.19 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_2375  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.88 
 
 		 394 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.525477 
 
 
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NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  41.29 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1975  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.88 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  40.75 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.54 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0011  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.05 
 
 		 400 aa  226  6e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.461677  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_10090  Drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  41.21 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0442276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0848  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.36 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2049  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.24 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1854  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.99 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.888494  normal  1 
 
 
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NC_008255  CHU_2159  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.79 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.832459 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.61 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.75 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.05 
 
 		 408 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0206  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  39.68 
 
 		 416 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.993392  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0183  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.68 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000244367  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0181  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.68 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0202  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  39.23 
 
 		 416 aa  216  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.23 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000813415  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0173  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.68 
 
 		 416 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181141  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_2780  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.33 
 
 		 399 aa  216  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.118826 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0226  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  39.43 
 
 		 416 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0202  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.89 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_3301  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.58 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.66 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.23 
 
 		 409 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0109  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.61 
 
 		 409 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  35.28 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22050  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.41 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.972538 
 
 
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NC_013595  Sros_5989  sugar (and other) transporter  42.3 
 
 		 411 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.291494  normal  0.241739 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3852  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.26 
 
 		 407 aa  210  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.64308  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.81 
 
 		 411 aa  209  8e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_013205  Aaci_0874  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.92 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.86 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  36.83 
 
 		 461 aa  209  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.4 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.47 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2514  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.25 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.92 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_2220  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.58 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_1841  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.13 
 
 		 418 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.47 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.09 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.47 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.58 
 
 		 408 aa  207  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0439856  normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0109  conserved hypothetical protein, putative drug resistance transporter, Bcr/CflA family  32.55 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000456469  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.71 
 
 		 458 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1599  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.46 
 
 		 384 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  36.16 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25390  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  40.62 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721605  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1982  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.83 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0827  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.32 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.68 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0184  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.6 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.39 
 
 		 405 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2625  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.14 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.88 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
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NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.61 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
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NC_014210  Ndas_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  37.43 
 
 		 437 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00219492  hitchhiker  0.00000496056 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  34 
 
 		 401 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1102  major facilitator superfamily permease  34.67 
 
 		 420 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.441898  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  34.32 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  33.16 
 
 		 393 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  37.44 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.59 
 
 		 405 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.86 
 
 		 415 aa  199  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.07 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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