123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2908 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  100 
 
 		 182 aa  377  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  81.25 
 
 		 164 aa  231  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  81.25 
 
 		 164 aa  231  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  66.43 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  62.26 
 
 		 155 aa  199  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  70.31 
 
 		 155 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  55.62 
 
 		 161 aa  191  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  57.67 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  65.35 
 
 		 174 aa  185  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  59.42 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  54.14 
 
 		 160 aa  180  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  58.22 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  51.57 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  49.68 
 
 		 162 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  51.37 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  52.45 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  52.45 
 
 		 162 aa  158  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  52.45 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  55.56 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  53.12 
 
 		 145 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  55.86 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  55.86 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  51.43 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  55.47 
 
 		 146 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  58.41 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  54.14 
 
 		 160 aa  141  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  54.69 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  50.69 
 
 		 149 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  49.65 
 
 		 149 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  46.05 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  52.52 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  52.52 
 
 		 152 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  135  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  44.71 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  53.17 
 
 		 153 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  47.92 
 
 		 149 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  48.89 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  45.95 
 
 		 142 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  45.27 
 
 		 142 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  50.78 
 
 		 159 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  50.78 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  47.55 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  45.27 
 
 		 142 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  45.27 
 
 		 142 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  45.04 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  47.66 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  47.9 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  43.71 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  53.51 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  40.67 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 161 aa  122  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  43.14 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  47.14 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  47.62 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  47.62 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  44.14 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  48.39 
 
 		 156 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  48.18 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  48.85 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  41.78 
 
 		 151 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  53.21 
 
 		 146 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  46.97 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  53.85 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  47.58 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  48.82 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  47.58 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  47.58 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  44.52 
 
 		 150 aa  115  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  46.46 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  45.04 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  45.07 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  40.58 
 
 		 154 aa  114  6.9999999999999995e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  48.28 
 
 		 153 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  47.01 
 
 		 147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  40.82 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  45.97 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  44.06 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  52.34 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  43.7 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  51.82 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  44 
 
 		 160 aa  111  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  43.7 
 
 		 217 aa  110  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  40.77 
 
 		 212 aa  110  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  43.15 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  46.9 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  40.77 
 
 		 212 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  42.86 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  50.46 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  45.22 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  44.74 
 
 		 172 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2133  hypothetical protein  42.34 
 
 		 142 aa  107  9.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  42.65 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  43.36 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  44.74 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  40.29 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  40.29 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3232  hypothetical protein  45.91 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>