123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1048 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  100 
 
 		 153 aa  312  9e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  55.84 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  59.84 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  52.7 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  50 
 
 		 153 aa  140  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  49.33 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  50.34 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  56.35 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  48.95 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  55.74 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  49.65 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  53.17 
 
 		 182 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  50.67 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  49.26 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  47.26 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  50.7 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  50 
 
 		 169 aa  128  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  43.92 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  57.01 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  47.41 
 
 		 149 aa  127  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  42.07 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  50.39 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  59.38 
 
 		 164 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  51.33 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  59.38 
 
 		 164 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  49.17 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  45.07 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  48.33 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  52.63 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  48.36 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  47.62 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  50.45 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  41.22 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  53.15 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  56 
 
 		 160 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  57.29 
 
 		 205 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  58.33 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  58.06 
 
 		 179 aa  120  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  50.41 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  55.66 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  52.68 
 
 		 172 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  44.76 
 
 		 162 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  45.59 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  51.11 
 
 		 142 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  46.46 
 
 		 198 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6118  copper resistance protein CopG  52.53 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.219885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  49.55 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  57.14 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  52.29 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  53.6 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  49.22 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  46.34 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  47.37 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  47.37 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  46.34 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  48.48 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  48.87 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  48.87 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  50.37 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  49.21 
 
 		 174 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  43.64 
 
 		 185 aa  114  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  45.08 
 
 		 162 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  50.37 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  59.57 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4389  hypothetical protein  40.56 
 
 		 147 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  55.32 
 
 		 214 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  50 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3232  hypothetical protein  51.97 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  50.41 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  48.67 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  41.73 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  47.32 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  46.72 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  46.72 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  46.72 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  49.11 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  43.7 
 
 		 172 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  32.93 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  41.48 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  56.25 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  43.93 
 
 		 182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  34.44 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  46.85 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  49.57 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  47.83 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  47.01 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  42.65 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  47.83 
 
 		 163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  35.94 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  41.96 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  44.78 
 
 		 172 aa  107  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2133  hypothetical protein  48.67 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  40.74 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  35.94 
 
 		 172 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  54.39 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  48.11 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  54.26 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>