123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1636 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  64.05 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  61.9 
 
 		 169 aa  197  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  69.6 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  60.53 
 
 		 161 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  63.71 
 
 		 205 aa  185  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  62.6 
 
 		 155 aa  181  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  54.14 
 
 		 182 aa  180  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  61.42 
 
 		 164 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  61.42 
 
 		 164 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  59.84 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  58.82 
 
 		 158 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  52.11 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  52.08 
 
 		 198 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  50 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  58.2 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  54.96 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  54.96 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  50 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  50 
 
 		 162 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  46.88 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  60.16 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  55.28 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  53.73 
 
 		 149 aa  143  8.000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  53.44 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  55.28 
 
 		 146 aa  141  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  57.72 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  46.25 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  53.38 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  53.38 
 
 		 152 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  50.99 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  48.7 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  46.15 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  46.15 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  50.98 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  48.55 
 
 		 144 aa  128  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  47.71 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  49.61 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  42.38 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  49.59 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  50.79 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  52.21 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  52.68 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  47.97 
 
 		 162 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  48.89 
 
 		 156 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  56 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  43.14 
 
 		 151 aa  121  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  44.72 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  41.45 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  39.37 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  43.51 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  44.36 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  44.2 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  42.75 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  117  6e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  46.81 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  44.16 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  45.07 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  45.97 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  51.26 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  44.59 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  45.77 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  42.21 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  45.53 
 
 		 158 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  43.65 
 
 		 214 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  47.54 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  43.85 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  43.51 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  43.65 
 
 		 216 aa  111  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  41.32 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  45.24 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  41.22 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  41.22 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  42.55 
 
 		 171 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  51.55 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  41.32 
 
 		 172 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  37.8 
 
 		 177 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  37.57 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  55.21 
 
 		 146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  47.11 
 
 		 162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  47.11 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  41.1 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  42.45 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  37.66 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  39.47 
 
 		 172 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  43.55 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  43.55 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  43.55 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  43.44 
 
 		 192 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  42.86 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  38.41 
 
 		 143 aa  103  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  38.41 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  40.31 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  36.09 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  35.34 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  37.16 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>