123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0145 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  100 
 
 
149 aa  308  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  58.04 
 
 
149 aa  180  7e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  55.03 
 
 
151 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  43.84 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  46.26 
 
 
146 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  49.23 
 
 
145 aa  136  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  48.46 
 
 
145 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  45.14 
 
 
144 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  50.41 
 
 
160 aa  133  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  48.46 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  42.86 
 
 
172 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  46.09 
 
 
181 aa  131  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  44.2 
 
 
185 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  47.45 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  43.8 
 
 
150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  45.97 
 
 
205 aa  130  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  45.45 
 
 
157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  42.66 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  44.22 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  44.22 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  46.1 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  40.85 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  48.12 
 
 
172 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  45.08 
 
 
158 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  42.03 
 
 
151 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  47.54 
 
 
174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  43.41 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  39.86 
 
 
198 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  46.28 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  39.86 
 
 
162 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  39.86 
 
 
162 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  40.94 
 
 
149 aa  127  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  45.97 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  41.6 
 
 
162 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  42.67 
 
 
149 aa  126  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  42.38 
 
 
160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  38.1 
 
 
162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  47.66 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  45 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  43.61 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  45.9 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  42.07 
 
 
153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  46.1 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  44.63 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  44.63 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  44.63 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  46.04 
 
 
146 aa  124  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  47.62 
 
 
153 aa  124  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  46.4 
 
 
156 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  40.43 
 
 
149 aa  122  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  45.31 
 
 
162 aa  122  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  42.19 
 
 
156 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  43.7 
 
 
154 aa  122  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  39.72 
 
 
149 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  39.73 
 
 
160 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  46.34 
 
 
160 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  43.06 
 
 
159 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4301  hypothetical protein  45.39 
 
 
143 aa  121  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  43.85 
 
 
164 aa  121  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  43.85 
 
 
164 aa  121  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  43.14 
 
 
182 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  39.57 
 
 
142 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  42.4 
 
 
155 aa  120  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  45.38 
 
 
145 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  48.74 
 
 
146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  39.57 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  38.57 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  46.28 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  38.85 
 
 
142 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  40.94 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  40.94 
 
 
171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  41.18 
 
 
168 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  43.55 
 
 
156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  36.67 
 
 
169 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  43.65 
 
 
174 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  42.74 
 
 
145 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  48.39 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  39.37 
 
 
171 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  44.35 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  45.31 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  114  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  44.19 
 
 
158 aa  114  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  37.5 
 
 
160 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  44.07 
 
 
214 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  39.55 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  43.31 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  43.33 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  39.06 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4389  hypothetical protein  41.73 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  40.56 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  40.32 
 
 
163 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  38.62 
 
 
161 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  40.32 
 
 
163 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  42.37 
 
 
217 aa  110  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  40.91 
 
 
147 aa  110  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  41.53 
 
 
212 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  40.16 
 
 
182 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  40.16 
 
 
172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>