124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1592 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  454  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  84.79 
 
 		 212 aa  382  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  85.25 
 
 		 212 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  63.55 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  65.05 
 
 		 214 aa  254  7e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  58.59 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  58.59 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  56.25 
 
 		 171 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  56.1 
 
 		 192 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  49.61 
 
 		 172 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  50.39 
 
 		 172 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  41.61 
 
 		 168 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 161 aa  141  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00317  transcriptional regulator, MerR family protein  47.32 
 
 		 114 aa  125  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  44.09 
 
 		 157 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  44.44 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  47.69 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  43.55 
 
 		 162 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  42.5 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  48.28 
 
 		 144 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  44.26 
 
 		 145 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  40.83 
 
 		 162 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  40.83 
 
 		 162 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  43.44 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  40.83 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  43.44 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  44.07 
 
 		 146 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  45.9 
 
 		 169 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  45 
 
 		 155 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  49.15 
 
 		 149 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  45.38 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  45.53 
 
 		 172 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  48.31 
 
 		 149 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  40.85 
 
 		 174 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  43.33 
 
 		 151 aa  112  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  43.7 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  46.61 
 
 		 151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  42.86 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  42.37 
 
 		 149 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  44.26 
 
 		 151 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  44.26 
 
 		 162 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  44.26 
 
 		 160 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  42.62 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  44.74 
 
 		 144 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  43.85 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  43.85 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  44.07 
 
 		 153 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  44.17 
 
 		 155 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  39.2 
 
 		 177 aa  108  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  41.73 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  41.73 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  41.09 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  35.66 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  39.85 
 
 		 149 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  43.2 
 
 		 153 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  44.92 
 
 		 150 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  43.44 
 
 		 161 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  44.92 
 
 		 142 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  38.64 
 
 		 170 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  43.33 
 
 		 149 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  40.85 
 
 		 158 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  42.37 
 
 		 149 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  45.45 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  40.68 
 
 		 170 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  42.54 
 
 		 160 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  41.46 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  41.46 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  41.46 
 
 		 151 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  36.51 
 
 		 173 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  34.51 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  43.59 
 
 		 149 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  44.07 
 
 		 142 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  40.68 
 
 		 149 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  44.07 
 
 		 142 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  39.02 
 
 		 151 aa  101  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  43.8 
 
 		 155 aa  101  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  44.07 
 
 		 142 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  40.68 
 
 		 145 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  41.53 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  46.96 
 
 		 162 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  39.83 
 
 		 145 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  51.06 
 
 		 153 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  43.65 
 
 		 158 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  38.89 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  40.68 
 
 		 150 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  32.89 
 
 		 185 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  44.8 
 
 		 156 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  43.97 
 
 		 153 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  42.11 
 
 		 154 aa  94.7  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  42.74 
 
 		 146 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  38.4 
 
 		 147 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  43.09 
 
 		 156 aa  94  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  38.21 
 
 		 143 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  37.82 
 
 		 181 aa  94  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  38.21 
 
 		 146 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  36.51 
 
 		 151 aa  92.4  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  42.86 
 
 		 124 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>