123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2419 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  51.09 
 
 		 151 aa  134  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  50.38 
 
 		 154 aa  134  9e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  48.41 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  53.45 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  50.43 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  47.54 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  49.61 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  44.53 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  45.08 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  47.41 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  53.04 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  49.58 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  36.16 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  53.98 
 
 		 155 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  46.55 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  47.66 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  50.77 
 
 		 150 aa  121  6e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  49.57 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  50.4 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2133  hypothetical protein  49.56 
 
 		 142 aa  120  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  41.38 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  46.55 
 
 		 145 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  54.87 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  51.3 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  51.59 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  51.22 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  50.91 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  54.95 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  41.94 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  42.14 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  47.93 
 
 		 161 aa  119  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  45.16 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  50 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  53.1 
 
 		 156 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  44.96 
 
 		 205 aa  117  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  53.98 
 
 		 142 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  35.23 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  34.97 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  34.97 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  47.97 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  53.1 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  53.98 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  36.42 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  45.04 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2545  hypothetical protein  44.63 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  49.21 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  35.23 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  41.8 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  40.26 
 
 		 212 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  32.98 
 
 		 212 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  41.73 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  43.8 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  40.8 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  45 
 
 		 151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  42.02 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  47.86 
 
 		 146 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  40 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  40.85 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  40 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  48.21 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  44.26 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  48.15 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  41.32 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  48.15 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  37.57 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  46.9 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  41.32 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  42.37 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  41.22 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  45.9 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  49.18 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  44.2 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  44.2 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  40.91 
 
 		 171 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  47.86 
 
 		 155 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  41.67 
 
 		 149 aa  107  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  49.46 
 
 		 145 aa  107  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  43.97 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  49.56 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  41.32 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  44.25 
 
 		 153 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  45.16 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  46.03 
 
 		 149 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  37.69 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  49.09 
 
 		 144 aa  105  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  44.7 
 
 		 151 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  39.57 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6118  copper resistance protein CopG  48.04 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.219885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  40.5 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  40.5 
 
 		 163 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  44 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4389  hypothetical protein  43.1 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  40.62 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  46.22 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  46.22 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  46.22 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>