123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2215 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  79.58 
 
 		 151 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  86.51 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  86.51 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  86.51 
 
 		 151 aa  234  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  81.54 
 
 		 151 aa  228  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  73.24 
 
 		 172 aa  225  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  70.14 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  69.44 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  68.75 
 
 		 142 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  64.86 
 
 		 149 aa  201  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  68.75 
 
 		 142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  65.96 
 
 		 144 aa  197  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  62.84 
 
 		 149 aa  194  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  60.84 
 
 		 144 aa  194  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  62.79 
 
 		 153 aa  179  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  52.86 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  42.86 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  44.6 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  46.88 
 
 		 205 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  45.52 
 
 		 168 aa  120  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  46.34 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  47.9 
 
 		 214 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  44 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  50.44 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  50.44 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  44.06 
 
 		 172 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  43.57 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  40.71 
 
 		 185 aa  116  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  45.97 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  42.98 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  39.74 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  45.59 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  43.36 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  46.62 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  43.51 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  47.06 
 
 		 151 aa  114  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  40.38 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  40.26 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  35.98 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  41.84 
 
 		 149 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  39.71 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  44.63 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  44.63 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  50.43 
 
 		 160 aa  110  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  41.91 
 
 		 216 aa  110  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  44.53 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  41.22 
 
 		 149 aa  110  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  40.29 
 
 		 212 aa  110  9e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  43.8 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  37.91 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  41.48 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  46.77 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  44.07 
 
 		 217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  37.25 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  49.18 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  41.8 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  40.3 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  44.88 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  45.22 
 
 		 145 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  36.6 
 
 		 173 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  45.6 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  46.15 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  42.52 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  47.5 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  38.46 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  45.54 
 
 		 182 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  39.01 
 
 		 198 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  47.11 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  39.19 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  38.46 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  42.11 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  49.47 
 
 		 155 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  36.51 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  39.86 
 
 		 149 aa  104  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  42.98 
 
 		 192 aa  104  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  43.06 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  37.04 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  44.7 
 
 		 179 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  40.41 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  42.98 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  39.13 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  38.31 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  38.71 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  38.76 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  38.71 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  46.79 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  41.86 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  42.37 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  37.9 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  40.32 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  36.62 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3232  hypothetical protein  46.32 
 
 		 162 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165768  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  40.68 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>