122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00317 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00317  transcriptional regulator, MerR family protein  100 
 
 		 114 aa  236  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  50 
 
 		 214 aa  137  6e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  53.57 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  49.11 
 
 		 212 aa  131  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  46.49 
 
 		 216 aa  128  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  49.12 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  47.32 
 
 		 217 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  48.25 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  49.11 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  48.25 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  48.21 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  48.21 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  46.43 
 
 		 212 aa  123  9e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  47 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  47.12 
 
 		 151 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  44.44 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  45.71 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  46.15 
 
 		 149 aa  91.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  43.27 
 
 		 154 aa  88.2  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  42.31 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  43.27 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  48.91 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  43.4 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  40.91 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  38.74 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  41.12 
 
 		 198 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  39.25 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  38.24 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  39.25 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  37.38 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  37.38 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  36.94 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  34.82 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  40.74 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  40.74 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  39.25 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  39.25 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  37.96 
 
 		 143 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  37.96 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  42.06 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  39.62 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  41.51 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  42.86 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  41.12 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  38.46 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  41.12 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  44.34 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  44.34 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4301  hypothetical protein  37.04 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  36.89 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  40.95 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  48.15 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  39.42 
 
 		 157 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  36.89 
 
 		 145 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  38.68 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  40.57 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  39.22 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  40.19 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  44.21 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  45.28 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  35.92 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  37.74 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  37.74 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  41.41 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  41.41 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  41.41 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  46.67 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  45.24 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  38.27 
 
 		 181 aa  73.6  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  40.78 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  45.68 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  40.57 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  41.41 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  38.68 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  35.92 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  41.49 
 
 		 144 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  36.45 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  40 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  42.55 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  42.55 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  43.21 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  38.46 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  37.14 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  38.6 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  36.45 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6118  copper resistance protein CopG  42.68 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.219885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  33.63 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  36.79 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  39.51 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  41.12 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2545  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  35.85 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  38.1 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  33.66 
 
 		 147 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>