123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1775 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  100 
 
 		 162 aa  336  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  83.33 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  83.33 
 
 		 163 aa  268  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  71.61 
 
 		 162 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  71.61 
 
 		 162 aa  249  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  71.61 
 
 		 198 aa  247  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  70.32 
 
 		 162 aa  246  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  83.33 
 
 		 145 aa  243  9e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  77.56 
 
 		 162 aa  230  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  58.6 
 
 		 169 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  56.76 
 
 		 161 aa  183  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  56.49 
 
 		 155 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  69.29 
 
 		 160 aa  180  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  62.4 
 
 		 155 aa  176  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  50.67 
 
 		 157 aa  169  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  59.06 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  52.11 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  58.23 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  49.68 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  54.84 
 
 		 205 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  52.42 
 
 		 174 aa  160  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  51.56 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  51.56 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  52.8 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  52.85 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  43.21 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  48.06 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  46.67 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  46.67 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  45.04 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  45.81 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  45.81 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  38.03 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  42.66 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  44.74 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  44.74 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  46.76 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  44.72 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  48.25 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  41.06 
 
 		 150 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  42.66 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  44.17 
 
 		 214 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  43.07 
 
 		 192 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  45.97 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  41.22 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  45.83 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  38.57 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  44.44 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  42.28 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  42.28 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  43.55 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  46.53 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  39.86 
 
 		 142 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  44.44 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  44.76 
 
 		 153 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  42.95 
 
 		 144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  43.44 
 
 		 212 aa  118  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  47.22 
 
 		 156 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  43.55 
 
 		 154 aa  117  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  42.36 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  39.68 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  47.15 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  36.5 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  46.53 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  42.74 
 
 		 212 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  38 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  42.28 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  40 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  40.44 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  36.84 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  44.35 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  43.52 
 
 		 177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  35.77 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  42.11 
 
 		 149 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  44.44 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  40.69 
 
 		 150 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  42.5 
 
 		 216 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  36.17 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  42.15 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  37.67 
 
 		 147 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  44 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  44.63 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  40.79 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  51.3 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  41.32 
 
 		 145 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  47.47 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  36.23 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  36.23 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  40.5 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  40.32 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  37.69 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  39.74 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  39.02 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  35.94 
 
 		 181 aa  104  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  42.86 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  37.93 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  44.72 
 
 		 155 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>