123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0065 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  324  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  55.84 
 
 		 153 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  54.25 
 
 		 156 aa  157  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  59.52 
 
 		 162 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  59.68 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  51.35 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  51.3 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  57.6 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  52.67 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  53.44 
 
 		 160 aa  144  5e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  50.79 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  55 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  50 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  55.56 
 
 		 124 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  57.76 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  45.58 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  53.78 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  50.83 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  54.92 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  44.44 
 
 		 185 aa  131  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  55.08 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  47.06 
 
 		 145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  53.57 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  46.58 
 
 		 154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  48.28 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  46.1 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  47.45 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  42.03 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  48.32 
 
 		 169 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  42.96 
 
 		 170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  47.9 
 
 		 170 aa  127  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  54.87 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6118  copper resistance protein CopG  61.46 
 
 		 137 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.219885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  46.28 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  51.59 
 
 		 205 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  54.78 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  53.1 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  53.1 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  46.76 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  53.51 
 
 		 182 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  51.24 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  50.86 
 
 		 198 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  40 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  49.12 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  54.39 
 
 		 142 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  42.36 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  48.36 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  50.79 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  48.36 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  48.36 
 
 		 162 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3232  hypothetical protein  53.8 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165768  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  53.51 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  50.4 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  53.51 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  45.26 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  39.73 
 
 		 149 aa  122  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  49.57 
 
 		 174 aa  120  6e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  51.3 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  50.83 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  44.59 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  45.07 
 
 		 182 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  51.3 
 
 		 174 aa  119  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  51.75 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  44.59 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  44.09 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  43.94 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  51.67 
 
 		 144 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  46.88 
 
 		 150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  48.67 
 
 		 157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4389  hypothetical protein  40.43 
 
 		 147 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  46.67 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  41.18 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  41.78 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  41.3 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  41.3 
 
 		 171 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  47.37 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  48.92 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  48.92 
 
 		 150 aa  114  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  48.67 
 
 		 214 aa  113  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  45.38 
 
 		 149 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0140  protein of unknown function DUF411  43.48 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  46.9 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  44.07 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  38.89 
 
 		 145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  44.26 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  44.36 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  44.36 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  44.36 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  44.54 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  42.4 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  45.7 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  44.57 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  50 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>