124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3132 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  8e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  79.37 
 
 		 162 aa  204  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  63.49 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  65.32 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  62.6 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  58.54 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  59.84 
 
 		 153 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  60.48 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  49.21 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  55.56 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  53.17 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3232  hypothetical protein  58.73 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165768  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  50.81 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  54.17 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  54.55 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  50.41 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  49.18 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  58.51 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  48.33 
 
 		 144 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  51.26 
 
 		 179 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  50.41 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  45.31 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  46.72 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  49.18 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  46.72 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  47.93 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  47.97 
 
 		 205 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  47.5 
 
 		 149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  46.09 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  49.59 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  52.89 
 
 		 155 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  47.5 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6118  copper resistance protein CopG  56.84 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.219885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  41.13 
 
 		 185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  46.67 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  49.18 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  45.83 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  47.11 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  45.9 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  47.54 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  49.58 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  42.86 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  46.49 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  43.09 
 
 		 170 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  42.28 
 
 		 162 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2545  hypothetical protein  46.77 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  43.09 
 
 		 170 aa  106  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  47.5 
 
 		 153 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  45.31 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  45.31 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  45.31 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  43.9 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  45.83 
 
 		 172 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  42.5 
 
 		 153 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  47.93 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  46.67 
 
 		 174 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  44.72 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  45.45 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  46.67 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  44.54 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  46.43 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  42.28 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  45.9 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  48.04 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2133  hypothetical protein  45.76 
 
 		 142 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  43.31 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  45.08 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  43.9 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  41.46 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  41.8 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  41.32 
 
 		 172 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  47.22 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  43.7 
 
 		 214 aa  99  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  40.5 
 
 		 172 aa  98.2  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  41.46 
 
 		 198 aa  97.1  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  43.31 
 
 		 168 aa  97.1  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  41.46 
 
 		 162 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  45.16 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0140  protein of unknown function DUF411  43.1 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  44.14 
 
 		 151 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  41.46 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  42.62 
 
 		 182 aa  95.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  41.46 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  41.46 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  41.46 
 
 		 163 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  40.65 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  38.66 
 
 		 177 aa  94.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  40.98 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  37.5 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  42.86 
 
 		 212 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  42.86 
 
 		 217 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  36.67 
 
 		 172 aa  91.3  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  38.02 
 
 		 171 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  46.4 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>