123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3488 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  351  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  70.7 
 
 
155 aa  227  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  70.97 
 
 
155 aa  200  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  66.44 
 
 
169 aa  198  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  62.18 
 
 
160 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  62.82 
 
 
161 aa  195  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  63.31 
 
 
205 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  57.23 
 
 
182 aa  189  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  60.77 
 
 
164 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  60.77 
 
 
164 aa  179  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  66.2 
 
 
158 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  60.48 
 
 
174 aa  176  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  55.94 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  55.94 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  55.94 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  55.24 
 
 
198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  54.79 
 
 
162 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  59.52 
 
 
145 aa  165  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  49.69 
 
 
157 aa  160  8.000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  56.69 
 
 
163 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  56.69 
 
 
163 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  62.5 
 
 
160 aa  157  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  54.69 
 
 
160 aa  148  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  55.2 
 
 
146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  51.54 
 
 
157 aa  143  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  57.94 
 
 
162 aa  142  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  51.94 
 
 
149 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  49.68 
 
 
159 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  52.45 
 
 
153 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  53.97 
 
 
144 aa  137  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  52.05 
 
 
156 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  46.9 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  55.93 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  49.66 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  51.88 
 
 
160 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  46.36 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  49.59 
 
 
162 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  57.02 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  42.86 
 
 
154 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  45.91 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  49.66 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  49.66 
 
 
152 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  45.28 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  44.81 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  46.26 
 
 
160 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  37.11 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  39.6 
 
 
144 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  51.24 
 
 
147 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  46.84 
 
 
154 aa  123  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  52.8 
 
 
162 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  45.89 
 
 
150 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  45.89 
 
 
150 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  47.66 
 
 
174 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  51.2 
 
 
151 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  45.16 
 
 
158 aa  121  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  49.24 
 
 
153 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  51.72 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  42.67 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  42.36 
 
 
151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
161 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  46.46 
 
 
171 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  48 
 
 
179 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  46.46 
 
 
171 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  47.93 
 
 
160 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  42.86 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  40.14 
 
 
151 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  45.71 
 
 
142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  45.39 
 
 
142 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  44.63 
 
 
214 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  40.16 
 
 
185 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  37.43 
 
 
170 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  37.43 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  45.67 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  45.6 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  44.44 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  50.41 
 
 
124 aa  115  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  46.03 
 
 
153 aa  115  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  44.68 
 
 
142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  42.31 
 
 
146 aa  114  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  42.31 
 
 
143 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  40.38 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  43.97 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  42.11 
 
 
144 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4301  hypothetical protein  41.54 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  40.25 
 
 
172 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  42.42 
 
 
172 aa  110  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  42.86 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  43.9 
 
 
168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  45.31 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  38.41 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  42.86 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  42.15 
 
 
216 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  42.06 
 
 
212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  46.21 
 
 
155 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  42.06 
 
 
212 aa  107  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  31.69 
 
 
172 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  43.2 
 
 
151 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  43.2 
 
 
151 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  43.2 
 
 
151 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>