123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4900 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  318  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  54.74 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  51.01 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  52.03 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  53.17 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  48.32 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  48.67 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  47.68 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  45.21 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  47.3 
 
 		 154 aa  136  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  45.31 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  48.98 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3232  hypothetical protein  55.19 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165768  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  45.8 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  52.73 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  54.13 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  44.97 
 
 		 154 aa  127  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  47.33 
 
 		 151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  50.42 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  42.58 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  50.91 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  41.06 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  49.17 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2545  hypothetical protein  42.66 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  43.23 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  44.14 
 
 		 185 aa  117  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  50 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  42.64 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  44.36 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  41.72 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2133  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  44.96 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  43.48 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  43.48 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  43.48 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  48.36 
 
 		 205 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  47.01 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  44.88 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  39.49 
 
 		 157 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  40.54 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  43.08 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  45.87 
 
 		 146 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  41.78 
 
 		 151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  49.09 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  43.93 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  36.9 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  44.44 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  42.11 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  38.26 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  36.43 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  47.71 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4389  hypothetical protein  37.78 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  47.71 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  40.88 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  35.34 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  36.43 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  35.37 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  39.55 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  45.3 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  38.03 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  42.03 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  40.68 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  40.98 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6118  copper resistance protein CopG  46.88 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.219885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  40.68 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  38.97 
 
 		 150 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  45.08 
 
 		 149 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  41.35 
 
 		 198 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  44.2 
 
 		 160 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  39.23 
 
 		 149 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  37.86 
 
 		 162 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  41.32 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  34.23 
 
 		 146 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  41.09 
 
 		 147 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0140  protein of unknown function DUF411  42.59 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4400  hypothetical protein  36.11 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  39.83 
 
 		 162 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  42.86 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  36.43 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  41.18 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  35.77 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  41.61 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  35.77 
 
 		 163 aa  97.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  36.57 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  43.9 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  42.02 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4301  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  41.73 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  40.48 
 
 		 157 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>