123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4301 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4301  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  296  8e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  99.3 
 
 		 143 aa  293  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  98.6 
 
 		 146 aa  291  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  43.88 
 
 		 150 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  43.18 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  45.39 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  44.44 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  47.54 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  41.94 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  41.94 
 
 		 170 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  43.48 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  40 
 
 		 151 aa  113  6.9999999999999995e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  39.22 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  41.3 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  43.44 
 
 		 205 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  43.26 
 
 		 149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  39.44 
 
 		 172 aa  110  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  45.83 
 
 		 157 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  41.54 
 
 		 172 aa  110  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  41.73 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  38.73 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  35 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  42.75 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  42.34 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2545  hypothetical protein  38.3 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  41.61 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  42.03 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  43.41 
 
 		 144 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  41.18 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  42.14 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  41.35 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  40.8 
 
 		 177 aa  105  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  39.52 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  40.88 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  40.88 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  38.57 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  39.84 
 
 		 155 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  39.2 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  39.71 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  41.22 
 
 		 146 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  37.16 
 
 		 169 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  38.85 
 
 		 161 aa  100  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  37.68 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  41.32 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  42.61 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  39.02 
 
 		 174 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  42.98 
 
 		 182 aa  99.8  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  37.69 
 
 		 151 aa  99.4  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  37.6 
 
 		 156 aa  98.6  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  37.88 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  41.46 
 
 		 153 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  39.29 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  41.94 
 
 		 160 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  40.34 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  41.53 
 
 		 151 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  40.94 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  97.4  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4614  hypothetical protein  39.31 
 
 		 155 aa  97.1  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.857535  normal  0.64967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  40.65 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  34.9 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  37.69 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  37.69 
 
 		 164 aa  96.3  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  40 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  36.92 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  36.92 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  35.06 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  35 
 
 		 214 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  40.16 
 
 		 151 aa  94.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  41.8 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  41.8 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  37.5 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  38.71 
 
 		 182 aa  93.6  8e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  39.37 
 
 		 174 aa  93.6  8e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2133  hypothetical protein  38.17 
 
 		 142 aa  93.6  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  40.98 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  39.55 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4900  hypothetical protein  36 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  40.98 
 
 		 162 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  38.69 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  37.14 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  37.14 
 
 		 150 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  39.06 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  40 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  34.29 
 
 		 216 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  38.76 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0465  conserved hypothetical protein (DUF411 domain protein)  36.8 
 
 		 181 aa  92.4  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.936935  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  39.23 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  38.21 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  40.35 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  35.51 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  38.19 
 
 		 153 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  34.93 
 
 		 198 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  37.4 
 
 		 217 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00311  putative metal-binding protein  37.4 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.53204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>