124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1809 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  413  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  75.78 
 
 
164 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  75.78 
 
 
164 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  59.88 
 
 
155 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  63.69 
 
 
182 aa  204  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  62.35 
 
 
174 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  63.12 
 
 
172 aa  197  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  62.84 
 
 
161 aa  197  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  71.31 
 
 
155 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  52.73 
 
 
169 aa  191  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  63.71 
 
 
160 aa  187  8e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  56.85 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  56.17 
 
 
158 aa  170  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  55.2 
 
 
198 aa  169  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  49.33 
 
 
162 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  49.33 
 
 
162 aa  168  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  49.33 
 
 
162 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  54.84 
 
 
162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  52.63 
 
 
145 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  58.54 
 
 
149 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  57.38 
 
 
157 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  52.8 
 
 
163 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  52.8 
 
 
163 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  61.79 
 
 
160 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  56.59 
 
 
144 aa  155  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  56.25 
 
 
146 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  55.56 
 
 
160 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  48.97 
 
 
149 aa  148  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  52.7 
 
 
152 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  52.7 
 
 
152 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  52.82 
 
 
150 aa  143  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  47.59 
 
 
149 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  40.62 
 
 
185 aa  142  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1836  protein of unknown function DUF411  51.88 
 
 
162 aa  142  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190449  hitchhiker  0.000714625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  48.23 
 
 
149 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  54.84 
 
 
158 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  48.78 
 
 
159 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  54.1 
 
 
158 aa  136  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3765  hypothetical protein  51.05 
 
 
150 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.154858  normal  0.256007 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4041  hypothetical protein  51.05 
 
 
150 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.613288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  50 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  43.78 
 
 
214 aa  134  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3987  protein of unknown function DUF411  49.62 
 
 
147 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  51.18 
 
 
160 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  45.97 
 
 
149 aa  132  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  47.27 
 
 
179 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  41.25 
 
 
149 aa  131  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  51.22 
 
 
142 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  43.31 
 
 
144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  48.82 
 
 
158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  42.54 
 
 
162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  45.32 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  52 
 
 
156 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  49.59 
 
 
142 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  43.66 
 
 
144 aa  128  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  47.62 
 
 
151 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  47.62 
 
 
151 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  47.62 
 
 
151 aa  128  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  51.2 
 
 
156 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  51.22 
 
 
160 aa  128  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  46.51 
 
 
151 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  47.45 
 
 
161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  50.37 
 
 
160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  46.25 
 
 
154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  46.88 
 
 
153 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  48.78 
 
 
142 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  53.64 
 
 
146 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0653  protein of unknown function, DUF  43.06 
 
 
151 aa  125  5e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00650125  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  47.97 
 
 
142 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  37.43 
 
 
172 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  48.36 
 
 
151 aa  124  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  51.13 
 
 
153 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  50.78 
 
 
155 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  44.8 
 
 
212 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  51.22 
 
 
162 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  45.74 
 
 
168 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  44.8 
 
 
217 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  46.28 
 
 
150 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  45.31 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  44 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  38.65 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  38.65 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  43.7 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  43.7 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1648  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  119  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0676923  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  44.96 
 
 
174 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  40.32 
 
 
145 aa  118  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  42.86 
 
 
153 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  39.22 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  40.4 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9870  hypothetical protein  45.45 
 
 
151 aa  117  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  41.26 
 
 
143 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  41.26 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1838  hypothetical protein  39.52 
 
 
145 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  44.09 
 
 
151 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  39.2 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  44.26 
 
 
149 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  47.97 
 
 
124 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00387  putative metal-binding protein  39.86 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.644994  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  38.52 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>