123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0829 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0829  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  299  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5430  hypothetical protein  75.54 
 
 		 149 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62390  hypothetical protein  73.57 
 
 		 149 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1826  hypothetical protein  71.33 
 
 		 142 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3534  hypothetical protein  71.33 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1853  hypothetical protein  72.79 
 
 		 142 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2203  hypothetical protein  70.63 
 
 		 142 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2553  hypothetical protein  62.5 
 
 		 172 aa  197  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5184  hypothetical protein  66.67 
 
 		 151 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.314093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07780  hypothetical protein  62.5 
 
 		 144 aa  192  9e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2215  hypothetical protein  67.16 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0219296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5377  hypothetical protein  71.54 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0011  hypothetical protein  69.84 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00250694  normal  0.180221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0013  hypothetical protein  69.84 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0011  hypothetical protein  69.84 
 
 		 151 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.680921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1499  hypothetical protein  61.24 
 
 		 153 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0801  hypothetical protein  51.11 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0560  hypothetical protein  55.37 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1808  hypothetical protein  44.59 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1155  hypothetical protein  46.76 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2908  hypothetical protein  48.89 
 
 		 182 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.579881  normal  0.0130755 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0650  hypothetical protein  51.22 
 
 		 146 aa  130  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.500455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1377  protein of unknown function DUF411  45.45 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.826285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3891  twin-arginine translocation pathway signal  52.59 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00492832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3790  hypothetical protein  45.27 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.656472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1809  hypothetical protein  47.2 
 
 		 205 aa  125  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536973 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004189  CopG protein  44.83 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0535  hypothetical protein  46.67 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1837  hypothetical protein  46.34 
 
 		 214 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0757746  normal  0.465801 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0065  hypothetical protein  50.4 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.310876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01267  hypothetical protein  44.83 
 
 		 149 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3937  ATP synthase F0, subunit B  48.31 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0360  hypothetical protein  41.41 
 
 		 185 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1206  protein of unknown function DUF411  52.29 
 
 		 164 aa  120  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.207689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2602  hypothetical protein  52.29 
 
 		 164 aa  120  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.245258  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1928  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.634719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0574  hypothetical protein  44.63 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0152863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3675  protein of unknown function DUF411  52.29 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1775  protein of unknown function DUF411  42.95 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0856709  normal  0.248389 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0365  RC180  43.97 
 
 		 198 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2643  hypothetical protein  51.26 
 
 		 151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2261  hypothetical protein  47.75 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3246  hypothetical protein  46.62 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.441974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1668  hypothetical protein  45.38 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.40389 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1274  hypothetical protein  45.52 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0477826  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0145  CopG protein  38.46 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1048  protein of unknown function DUF411  48.48 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0448  hypothetical protein  43.54 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.673346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1353  metal-binding protein-like  45.08 
 
 		 182 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.184569  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1113  RC180  41.89 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1344  hypothetical protein  43.9 
 
 		 216 aa  112  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2881  periplasmic protein  41.22 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2729  hypothetical protein  41.89 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2533  hypothetical protein  44.36 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3616  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0453249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3954  hypothetical protein  44.59 
 
 		 152 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.147787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1268  hypothetical protein  45.99 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000147715 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5104  protein of unknown function DUF411  50.43 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0385442 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5340  protein of unknown function DUF411  47.15 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1968  hypothetical protein  45.54 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0215  hypothetical protein  47.71 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1723  protein of unknown function DUF411  47.15 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0450  hypothetical protein  42.98 
 
 		 173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0263  hypothetical protein  44.19 
 
 		 143 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3421  hypothetical protein  44.19 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.600655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1002  protein of unknown function DUF411  51.38 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0636207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0698  hypothetical protein  45.61 
 
 		 212 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.564854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12831  metal-binding protein  42.42 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1387  protein of unknown function DUF411  42.5 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1259  hypothetical protein  44.72 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1592  hypothetical protein  44.74 
 
 		 217 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.21301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2485  hypothetical protein  44.53 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1212  hypothetical protein  45.76 
 
 		 177 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00298845  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4286  hypothetical protein  43.2 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0248  hypothetical protein  43.2 
 
 		 171 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3488  hypothetical protein  42.65 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1707  hypothetical protein  38.62 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2622  hypothetical protein  42.86 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.406284  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4301  hypothetical protein  43.41 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0709  hypothetical protein  44.25 
 
 		 212 aa  107  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.187795 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0494  hypothetical protein  42.66 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.132085 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12761  metal-binding protein  46.36 
 
 		 172 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.032506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2147  protein of unknown function DUF411  49.59 
 
 		 179 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.716835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2562  protein of unknown function DUF411  52.43 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157715  normal  0.0179855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2419  hypothetical protein  49.09 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.709936 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7980  protein of unknown function DUF411  47.76 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761701  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1636  hypothetical protein  40.91 
 
 		 160 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.254762  normal  0.0395738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4590  hypothetical protein  47.41 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00406167  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1018  protein of unknown function DUF411  43.48 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4113  protein of unknown function DUF411  50.47 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0275  hypothetical protein  40.65 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.286221  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3132  hypothetical protein  44.72 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.411198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1108  protein of unknown function DUF411  49.11 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.0443803 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1364  hypothetical protein  47.41 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1695  hypothetical protein  49.53 
 
 		 146 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3547  hypothetical protein  42.34 
 
 		 192 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000884847  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1657  hypothetical protein  43.24 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2027  hypothetical protein  43.24 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00710085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2348  hypothetical protein  47.06 
 
 		 160 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2545  hypothetical protein  39.73 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>