226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0619 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  942    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46 
 
 
479 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  37.6 
 
 
495 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  39.74 
 
 
477 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  41.72 
 
 
478 aa  270  5e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.42 
 
 
479 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.57 
 
 
482 aa  260  3e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  38.03 
 
 
477 aa  256  6e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.32 
 
 
447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  35.15 
 
 
445 aa  199  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30.8 
 
 
458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  30.13 
 
 
441 aa  169  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  32.93 
 
 
465 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.9 
 
 
482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  31.14 
 
 
490 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.03 
 
 
452 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.52 
 
 
468 aa  162  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.01 
 
 
472 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  32.52 
 
 
468 aa  161  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  32.52 
 
 
468 aa  161  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  32.52 
 
 
468 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  31.01 
 
 
471 aa  160  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  32.32 
 
 
468 aa  160  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.26 
 
 
457 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  30.34 
 
 
487 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  31.81 
 
 
474 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  29.3 
 
 
468 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  29.18 
 
 
468 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.32 
 
 
456 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.96 
 
 
457 aa  151  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.92 
 
 
468 aa  151  3e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  31.11 
 
 
471 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.14 
 
 
477 aa  150  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.77 
 
 
453 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  32.19 
 
 
668 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.43 
 
 
462 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  30.61 
 
 
456 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  29.77 
 
 
467 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.04 
 
 
455 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.21 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.61 
 
 
466 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  29.57 
 
 
467 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  29.57 
 
 
467 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  30.41 
 
 
466 aa  143  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  29.17 
 
 
458 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  29.85 
 
 
669 aa  143  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.81 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  30.2 
 
 
466 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.25 
 
 
469 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.93 
 
 
456 aa  140  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.84 
 
 
457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.6 
 
 
454 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  30.12 
 
 
665 aa  140  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  28.68 
 
 
677 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  26.22 
 
 
456 aa  138  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  30.43 
 
 
454 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.19 
 
 
465 aa  136  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  30.35 
 
 
441 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  30.35 
 
 
441 aa  136  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  28.63 
 
 
498 aa  136  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.15 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  29.9 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  28.72 
 
 
454 aa  134  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  28.76 
 
 
513 aa  134  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 
507 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  27.67 
 
 
507 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.74 
 
 
470 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.97 
 
 
475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 
507 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.97 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  27.45 
 
 
507 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.08 
 
 
471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.04 
 
 
474 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.54 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.12 
 
 
488 aa  127  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  27.74 
 
 
477 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.2 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.26 
 
 
514 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  28.87 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.01 
 
 
678 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.65 
 
 
476 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.01 
 
 
678 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  28.69 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.13 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.54 
 
 
487 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  26.75 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.57 
 
 
657 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.2 
 
 
680 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.2 
 
 
680 aa  117  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25.99 
 
 
437 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  27.33 
 
 
452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.29 
 
 
505 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1580  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.2 
 
 
473 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.94 
 
 
479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  27.84 
 
 
505 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  27.27 
 
 
452 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.03 
 
 
499 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>