138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1424 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1424  CheW protein  100 
 
 
191 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.27097  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2779  CheW protein  42.29 
 
 
180 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3338  CheW protein  42.29 
 
 
180 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2788  CheW protein  43.56 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4056  CheW protein  30.23 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4018  CheW protein  30.23 
 
 
178 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3777  CheW protein  29.45 
 
 
157 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0060  CheW protein  31.94 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202075  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2794  CheW protein  32.19 
 
 
165 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0716  CheW protein  29.53 
 
 
160 aa  78.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0857  CheW protein  32.41 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.201526  normal  0.0222726 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0414  CheW protein  29.17 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.557744  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  30 
 
 
162 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3001  CheW protein  27.01 
 
 
176 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3247  CheW protein  26.75 
 
 
172 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  30.71 
 
 
159 aa  57.4  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 
164 aa  57.8  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.06 
 
 
174 aa  55.8  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0750  CheW protein  27.59 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0721  CheW protein  27.59 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0581  CheW protein  28.87 
 
 
331 aa  55.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4604  CheW protein  28.78 
 
 
182 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.447747 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  26.62 
 
 
164 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  26.62 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1063  CheW protein  31.25 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.646648  hitchhiker  0.0000389195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  26.62 
 
 
163 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1094  CheW protein  31.3 
 
 
168 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0267414  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  28.06 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0507  CheW protein  26.9 
 
 
176 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  26.45 
 
 
161 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4951  CheW protein  26.06 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1053  CheW protein  30.83 
 
 
178 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1489  CheW domain-containing protein  31.3 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00055258  normal  0.88086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1184  CheW protein  26.47 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0668983 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  25.9 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  28.37 
 
 
164 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4233  putative CheW protein  31.3 
 
 
168 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0209  CheW protein  23.78 
 
 
150 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.53 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  29.51 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  26.62 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.9 
 
 
161 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  26.09 
 
 
159 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1886  CheW protein  29.32 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3746  CheW protein  27.08 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  25.32 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0240  putative CheW protein  28.9 
 
 
325 aa  48.5  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.476867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  26.09 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  26.81 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  26.09 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  26.09 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  26.09 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  25.9 
 
 
164 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.9 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0211  putative CheW protein  23.08 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.26 
 
 
173 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.26 
 
 
173 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  25.26 
 
 
173 aa  47.8  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  28.7 
 
 
173 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  27.34 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0728  CheW protein  29.23 
 
 
185 aa  47.8  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000233542  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  29.03 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  27.59 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  24.72 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.44 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  26.32 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0007  CheW protein  30.68 
 
 
169 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  27.54 
 
 
159 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0822  putative CheW protein  21.38 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0317  purine-binding chemotaxis protein  24.46 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.32 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3245  CheW protein  26.72 
 
 
528 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128469  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  26.81 
 
 
159 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1832  CheW protein  30.58 
 
 
184 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0194575  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  29.46 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1430  hypothetical protein  31.25 
 
 
171 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.656805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1537  CheW protein  25.77 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.72 
 
 
165 aa  45.4  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  30.63 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0793  CheW protein  26.87 
 
 
365 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4744  CheW protein  44.68 
 
 
175 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  30.63 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  25.23 
 
 
159 aa  44.7  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0598  CheW protein  43.75 
 
 
211 aa  44.7  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16440  hypothetical protein  31.71 
 
 
171 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910031  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1450  chemotaxis signal transduction protein  27.7 
 
 
518 aa  44.7  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  28.57 
 
 
185 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1016  CheW protein  30.88 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.130392  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3972  putative chemotaxis signal transduction protein CheW  31.97 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000117333  hitchhiker  0.0039114 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  27.5 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  30 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>