More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1257 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 
429 aa  873    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
429 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  70.62 
 
 
429 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  72.45 
 
 
430 aa  610  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  71.26 
 
 
435 aa  598  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  58.23 
 
 
445 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 
423 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 
430 aa  456  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 
436 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  51.44 
 
 
426 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
423 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  49.51 
 
 
426 aa  428  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06881  histidyl-tRNA synthetase  50.9 
 
 
429 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
426 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
426 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
419 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  52.64 
 
 
423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  51.19 
 
 
424 aa  404  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
423 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1332  histidyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
421 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1393  histidyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
421 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
424 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
424 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
424 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
423 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  50.48 
 
 
431 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
419 aa  388  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
424 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
424 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
424 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
433 aa  391  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 
420 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
423 aa  388  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  50.24 
 
 
422 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
421 aa  387  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  385  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  385  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
424 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
419 aa  386  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
424 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0405  histidyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
425 aa  385  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 
424 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 
424 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  385  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
429 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
430 aa  386  1e-106  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  386  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 
423 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
422 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3499  histidyl-tRNA synthetase  53.13 
 
 
428 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 
424 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
432 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
423 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
429 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
423 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  49.28 
 
 
422 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  49.63 
 
 
447 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  49.01 
 
 
423 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 
429 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 
425 aa  380  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 
424 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  51.09 
 
 
429 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
446 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 
426 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
446 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
450 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 
427 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 
425 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  50.85 
 
 
429 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2867  histidyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 
433 aa  378  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
450 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 
424 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0653  histidyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
434 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.75164  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 
446 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  49.65 
 
 
424 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  50 
 
 
423 aa  378  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
426 aa  373  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0683  histidyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 
442 aa  374  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00834404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>