More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2979 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2979  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  100 
 
 
591 aa  1108    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.509004  normal  0.201777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  31.17 
 
 
501 aa  233  7.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  37.38 
 
 
481 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  30.55 
 
 
500 aa  206  7e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  30.35 
 
 
500 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2515  xylulokinase  37.8 
 
 
472 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.898924  normal  0.571015 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  31.45 
 
 
518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  32.1 
 
 
499 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.84 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.84 
 
 
492 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.33 
 
 
512 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  33.18 
 
 
496 aa  194  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  29.75 
 
 
509 aa  193  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0502  xylulokinase  32.61 
 
 
496 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0394254  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.74 
 
 
509 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  35.23 
 
 
498 aa  188  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  27.94 
 
 
496 aa  187  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  30.67 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  32.65 
 
 
548 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  31.61 
 
 
511 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.38 
 
 
509 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  31.64 
 
 
517 aa  181  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  31.64 
 
 
517 aa  180  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  32.6 
 
 
484 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.95 
 
 
499 aa  177  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  32.94 
 
 
487 aa  176  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1235  xylulokinase  36.27 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.757817  normal  0.113808 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0853  xylulokinase  34.28 
 
 
492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985754  normal  0.66346 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  34.17 
 
 
494 aa  174  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  27.66 
 
 
490 aa  174  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  36.11 
 
 
472 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.98 
 
 
505 aa  171  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2691  xylulokinase  34.92 
 
 
501 aa  171  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2464  xylulokinase  34.75 
 
 
484 aa  171  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.542449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.54 
 
 
502 aa  171  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  34.71 
 
 
493 aa  170  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.91 
 
 
493 aa  170  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  33.87 
 
 
496 aa  170  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.5 
 
 
530 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0055  xylulokinase  31.95 
 
 
484 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0697  xylulokinase  35.32 
 
 
499 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0014259 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.57 
 
 
503 aa  167  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.99 
 
 
489 aa  167  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  32.46 
 
 
484 aa  167  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1429  glycerol kinase  27.06 
 
 
479 aa  167  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0184137  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4060  xylulokinase  31.21 
 
 
484 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  32.46 
 
 
484 aa  167  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0703  xylulokinase  32.7 
 
 
487 aa  167  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.872008  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  31.46 
 
 
509 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0150  xylulokinase  30.88 
 
 
484 aa  166  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2525  carbohydrate kinase FGGY  35.52 
 
 
503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.49855  normal  0.157828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3833  xylulokinase  33.63 
 
 
489 aa  166  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.967873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  32.49 
 
 
511 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.52 
 
 
488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  31.48 
 
 
506 aa  165  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2629  carbohydrate kinase FGGY  36.34 
 
 
483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03416  xylulokinase  30.88 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3767  xylulokinase  30.88 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03367  hypothetical protein  30.88 
 
 
484 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  31.85 
 
 
485 aa  165  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  33.87 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  26.84 
 
 
486 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4940  xylulokinase  31.15 
 
 
484 aa  163  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0856501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1995  carbohydrate kinase, FGGY  36.56 
 
 
483 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2605  carbohydrate kinase, FGGY  36.56 
 
 
483 aa  163  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0146  xylulokinase  30.67 
 
 
484 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0692  carbohydrate kinase FGGY  37.31 
 
 
478 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.93533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3710  xylulokinase  32.05 
 
 
484 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.917033  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  33.72 
 
 
493 aa  163  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  31.36 
 
 
484 aa  163  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6709  xylulokinase (xylulose kinase)  33.2 
 
 
481 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566746  normal  0.0890509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3887  xylulokinase  30.47 
 
 
484 aa  163  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.49 
 
 
493 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  33.94 
 
 
493 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5936  carbohydrate kinase, FGGY  37.44 
 
 
488 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53174  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  34.49 
 
 
492 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  33.95 
 
 
493 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  33.95 
 
 
493 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.49 
 
 
493 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.79 
 
 
483 aa  160  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.79 
 
 
483 aa  161  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3412  xylulokinase  32.25 
 
 
484 aa  160  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.636398  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.59 
 
 
515 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2791  xylulokinase  32.82 
 
 
484 aa  159  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.565277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  29.74 
 
 
484 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2652  carbohydrate kinase, FGGY  36.74 
 
 
488 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  33.03 
 
 
508 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2478  carbohydrate kinase FGGY  32.74 
 
 
477 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  32.82 
 
 
504 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  32.79 
 
 
491 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3874  xylulokinase  29.93 
 
 
484 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  33.97 
 
 
492 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  33.97 
 
 
492 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  33.97 
 
 
492 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  33.33 
 
 
490 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0864  carbohydrate kinase  34.88 
 
 
474 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.41 
 
 
506 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  33.33 
 
 
490 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2713  xylulose kinase  33.94 
 
 
485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  33.33 
 
 
490 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>