More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2322 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2322  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
357 aa  698    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131448  normal  0.0414369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2555  transcriptional regulator, LacI family  62.57 
 
 
369 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679604  normal  0.216267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4733  transcriptional regulator, LacI family  56.18 
 
 
341 aa  329  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.396374  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0809  transcriptional regulator, LacI family  38.99 
 
 
349 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1554  LacI family transcriptional regulator  41 
 
 
344 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0989  transcriptional regulator, LacI family  35.24 
 
 
342 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4547  transcriptional regulator, LacI family  34.52 
 
 
342 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3847  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 
337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150933  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6174  transcriptional regulator, LacI-family  33.82 
 
 
349 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3841  regulatory protein LacI  36.45 
 
 
332 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.627459 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3910  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.93 
 
 
335 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83437  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4528  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
360 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3954  regulatory protein LacI  30.63 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.226118  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4014  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.63 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0637146  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3845  transcriptional regulator, LacI-family  30.03 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587178  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3832  regulatory protein LacI:Periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.33 
 
 
335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0370934  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  32.16 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0673  regulatory protein, LacI  33.53 
 
 
341 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.371597  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1119  LacI family transcription regulator  32.77 
 
 
347 aa  113  5e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140598 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 
353 aa  112  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5001  LacI family transcription regulator  34.38 
 
 
343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282758  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4130  transcriptional regulator, LacI family  34.69 
 
 
344 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  33.43 
 
 
349 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1769  LacI family transcription regulator  27.83 
 
 
339 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  31.59 
 
 
341 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2720  transcriptional regulator, LacI family  32.77 
 
 
337 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.687845  normal  0.476409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  28.7 
 
 
368 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  32.48 
 
 
365 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.2 
 
 
348 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 
331 aa  104  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  30.81 
 
 
339 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2575  transcriptional regulator, LacI family  25.67 
 
 
340 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000166441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2403  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 
379 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00011763  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2012  transcriptional regulator, LacI family  32.47 
 
 
342 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0794313 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2268  transcriptional regulator, LacI family  29.28 
 
 
339 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.580288  hitchhiker  0.000512159 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5165  LacI family transcription regulator  30.79 
 
 
330 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5637  LacI family transcription regulator  32.39 
 
 
338 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339737  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4069  LacI family transcription regulator  30.98 
 
 
367 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5490  transcriptional regulator, LacI family  29.86 
 
 
337 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932078  normal  0.122051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0186  transcriptional regulator, LacI family  33.91 
 
 
330 aa  102  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.319705  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3452  LacI family transcription regulator  30.98 
 
 
369 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.164472  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  30.09 
 
 
333 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0920  LacI family transcription regulator  31.42 
 
 
351 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.830745  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2717  LacI family transcription regulator  31.35 
 
 
330 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  28.07 
 
 
340 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  26.41 
 
 
388 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 
339 aa  100  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5235  LacI family transcription regulator  31.03 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 
334 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3401  LacI family transcription regulator  31.03 
 
 
367 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3227  LacI family transcription regulator  28.86 
 
 
362 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1119  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.158873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2275  transcriptional regulator, LacI family  32.63 
 
 
342 aa  99.4  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0276  LacI family transcription regulator  31.01 
 
 
347 aa  99  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  32.18 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14780  transcriptional regulator  33.22 
 
 
355 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.111834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  32.08 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3013  transcriptional regulator, LacI family  32.06 
 
 
326 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168933  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  30.29 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 
342 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0081  transcriptional regulator, LacI family  26.81 
 
 
327 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0948  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.26 
 
 
337 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.849116  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4925  transcriptional regulator, LacI family  32.28 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  24.72 
 
 
333 aa  98.6  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  29.1 
 
 
346 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  25.62 
 
 
337 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3513  LacI family transcriptional regulator  31.94 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0909  LacI family transcription regulator  31.27 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0282  LacI family transcriptional regulator  30.14 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.727359 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4647  LacI family transcriptional regulator  29.86 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0134194  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  30.11 
 
 
346 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  25.97 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1609  LacI family transcription regulator  29.67 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  30.52 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3586  transcriptional regulator, LacI family  32.37 
 
 
333 aa  96.7  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0119  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.7 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0810079  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5754  transcriptional regulator, LacI family  32.76 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.597528  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  24.26 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16820  transcriptional regulator  31.5 
 
 
385 aa  96.7  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0968844  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  30.37 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  29.6 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  29.3 
 
 
348 aa  96.3  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1481  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 
342 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  23.75 
 
 
338 aa  96.3  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  25.97 
 
 
328 aa  95.9  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2253  transcriptional regulator, LacI family  31.44 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000862042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2405  LacI family transcriptional regulator  29.91 
 
 
333 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.475476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  32.35 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6588  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 
342 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2686  transcriptional regulator, LacI family  29.46 
 
 
340 aa  94.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  24.41 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6569  transcriptional regulator, LacI family  29.33 
 
 
347 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0434919  normal  0.571175 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  30.2 
 
 
340 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  29.65 
 
 
341 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03609  transcriptional regulator LacI family  31.33 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.34339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 
336 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  30.66 
 
 
343 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3601  transcriptional regulator, LacI family  32.75 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0229751  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>