72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2308 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2308  CheC-like protein  100 
 
 		 154 aa  309  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0634  CheC domain protein  53.95 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2263  CheC domain protein  46.72 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000104148  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1493  chemotaxis protein CheX  26.8 
 
 		 154 aa  80.1  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  28.29 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2134  CheC domain protein  33.12 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0126  CheC-like protein  30.22 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000893437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0151  CheC domain-containing protein  31.71 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.176363  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2279  CheC domain protein  28.99 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0352491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0826  CheC domain-containing protein  28.45 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1768  CheC-like protein  25.32 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1446  CheX protein (uncharacterized ORF in chemotaxis operon)  28.29 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0035  CheC domain protein  26.28 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1282  CheC domain-containing protein  26.62 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.233529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1173  CheC domain-containing protein  27.34 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.362697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1832  CheC domain-containing protein  30.4 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000797818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  25.5 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1063  CheC domain protein  25.32 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2679  chemotaxis protein CheX, putative  25.69 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.513529 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1932  CheC domain protein  22.97 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0227289  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  25 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  24.11 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  23.45 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  27.05 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  25.16 
 
 		 154 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  25.16 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1447  chemotaxis operon protein  24.41 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  24.82 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.86 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  25.16 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  25.16 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  25.16 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  25.16 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3056  putative chemotaxis protein CheX  22.88 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.23032  normal  0.617715 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  25.16 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0523  CheC-like protein  26.28 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000195961  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0760  putative chemotaxis protein CheX  22.73 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000652399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  27.13 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.54 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1196  chemotaxis protein CheX, putative  23.94 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3344  CheC domain-containing protein  23.23 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  23.94 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0765  putative chemotaxis protein CheX  22.88 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  24.59 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2787  hypothetical protein  23.23 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.834766  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00011  chemotaxis protein CheX  24.19 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002342  chemotaxis protein CheX  24.19 
 
 		 153 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  27.82 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  25 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0386  putative chemotaxis protein  24.19 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.352728  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1604  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.25 
 
 		 464 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0691  CheC-like family protein  25.9 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0452521  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1176  CheC-like protein  33.75 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  22.94 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  26.85 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  25.17 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0409  cheC-like family protein  26.67 
 
 		 154 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  21.53 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.75 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000167071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0023  CheC, inhibitor of MCP methylation  28.75 
 
 		 204 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.682012  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.07 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  24.07 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  27.97 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  22.94 
 
 		 158 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1769  inhibitor of MCP methylation-like protein  25.78 
 
 		 217 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0802325  hitchhiker  0.000530497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4204  CheC domain-containing protein  22.73 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.994344  hitchhiker  0.00000174212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1092  putative chemotaxis protein CheX  24.51 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  20.41 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  25.71 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1433  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.25 
 
 		 205 aa  40.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1439  CheC, inhibitor of MCP methylation  27.27 
 
 		 207 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0815447  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0492  CheC, inhibitor of MCP methylation  37.97 
 
 		 206 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>