More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0610 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 355 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  61.54 
 
 		 353 aa  451  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  54.96 
 
 		 353 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  51.57 
 
 		 357 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  51.83 
 
 		 356 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  53.82 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 359 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 356 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  52.56 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  49.72 
 
 		 359 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  53.31 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  50.73 
 
 		 348 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  50.44 
 
 		 348 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  52.26 
 
 		 354 aa  377  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  52.03 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  47.74 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  50.15 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  49.43 
 
 		 350 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  50 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  48.86 
 
 		 351 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  50.99 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  48.57 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  46.89 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  48.57 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  50.15 
 
 		 348 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  49.71 
 
 		 357 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  51.62 
 
 		 351 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  47.74 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  46.89 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  46.89 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  50.42 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  47.89 
 
 		 357 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  47.18 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  46.22 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  51.33 
 
 		 351 aa  364  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  47.19 
 
 		 356 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  48.86 
 
 		 352 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 		 355 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  46.91 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  46.91 
 
 		 356 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  51.33 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  47.74 
 
 		 355 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  46.63 
 
 		 357 aa  359  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  49 
 
 		 356 aa  358  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  48.7 
 
 		 349 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  48.43 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  49.85 
 
 		 350 aa  358  7e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  46.63 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  46.63 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  46.63 
 
 		 357 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  47.86 
 
 		 355 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  49.29 
 
 		 351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  47.32 
 
 		 362 aa  356  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 355 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  49.25 
 
 		 356 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  47.04 
 
 		 355 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  46.51 
 
 		 367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  46.53 
 
 		 377 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  47.11 
 
 		 377 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  40.23 
 
 		 356 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  39.94 
 
 		 350 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  40.77 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  37.39 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  38.84 
 
 		 347 aa  235  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 		 350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  39.71 
 
 		 350 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  37.91 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  40 
 
 		 350 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  34.28 
 
 		 358 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  35.26 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  33.52 
 
 		 365 aa  219  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  34.83 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  30.51 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  32.22 
 
 		 373 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.92 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  30.77 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2405  histidinol-phosphate aminotransferase  28.45 
 
 		 389 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  28.69 
 
 		 370 aa  169  5e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  29.75 
 
 		 358 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  30.47 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  29.3 
 
 		 370 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  32.43 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0846  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3264  histidinol-phosphate aminotransferase  29.71 
 
 		 368 aa  159  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  29.92 
 
 		 358 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  30.06 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1198  histidinol-phosphate aminotransferase  28.85 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1902  histidinol-phosphate aminotransferase  32.63 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  30.63 
 
 		 358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1811  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2197  histidinol-phosphate aminotransferase  28.06 
 
 		 366 aa  155  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  31.14 
 
 		 358 aa  155  9e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>