45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4771 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4771  response regulator receiver protein  100 
 
 		 106 aa  221  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0255071  normal  0.533195 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4203  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.642099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2215  response regulator receiver protein  35.42 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01349  regulatory protein  30.93 
 
 		 294 aa  51.6  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0319179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5058  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.59 
 
 		 247 aa  50.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000256301  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7298  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.33 
 
 		 230 aa  50.4  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5950  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.47 
 
 		 253 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.792388  normal  0.0587504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5230  two component transcriptional regulator, LytTR family  27 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.236835  normal  0.031416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1177  two component transcriptional regulator, LytTR family  25.24 
 
 		 231 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3622  response regulator receiver protein  28.87 
 
 		 301 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  27.27 
 
 		 241 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1191  response regulator receiver protein  31.52 
 
 		 518 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.93 
 
 		 243 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0439  response regulator receiver protein  39.68 
 
 		 215 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.03 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3926  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.76 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.566728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  32.93 
 
 		 243 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  29.03 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12230  response regulator of the LytR/AlgR family  23.81 
 
 		 242 aa  42  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  41.07 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0826  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.19 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.398179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1746  carbon monoxide dehydrogenase, coxC signalling protein  33.33 
 
 		 410 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  23.47 
 
 		 261 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  25.25 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 237 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1167  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.42 
 
 		 245 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3628  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.66 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0184746 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0991  LytTR family two component transcriptional regulator  26.56 
 
 		 229 aa  40.8  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1862  putative methyl-accepting/DNA response regulator  33.77 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1977  putative methyl-accepting/DNA response regulator  34.92 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3480  putative methyl-accepting/DNA response regulator  33.77 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0914796 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1703  transcriptional regulatory protein  33.77 
 
 		 214 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1899  putative methyl-accepting/DNA response regulator  34.92 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.03 
 
 		 248 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 258 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4004  response regulator receiver domain-containing protein  29 
 
 		 269 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174802  normal  0.249031 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1861  methyl-accepting/DNA response regulator  34.92 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1725  methyl-accepting/DNA response regulator  34.92 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.96 
 
 		 251 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1947  methyl-accepting/DNA response regulator, putative  34.92 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5598  two component transcriptional regulator, LytTR family  23.88 
 
 		 237 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1065  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 249 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251377  normal  0.725191 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1677  transcriptional regulatory protein  34.92 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0486  DNA-binding response regulator  30.23 
 
 		 238 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0347807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>