More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4275 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  100 
 
 
203 aa  424  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.66 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1044  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
265 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  37 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  37.37 
 
 
207 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  37.14 
 
 
243 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  37.11 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  38.1 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.24 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.54 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.09 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  33 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  35.71 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.45 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  33.86 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.93 
 
 
224 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.9 
 
 
282 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.34 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  28.73 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  37.62 
 
 
238 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
243 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 
250 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
241 aa  62  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 
265 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
272 aa  61.6  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3118  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
225 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2974  methyltransferase type 11  32.11 
 
 
225 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  36.63 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.51 
 
 
296 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.97 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16171  hypothetical protein  34.21 
 
 
287 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.80652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  36.54 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  36 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  30.23 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  36 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  36.54 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  36 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_550  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.95 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00760121  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.89 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  36.54 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  37.27 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  36 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35 
 
 
258 aa  59.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  33.65 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  32.26 
 
 
212 aa  59.3  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
266 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  36.54 
 
 
197 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  31.06 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  31.06 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  33.98 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.92 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
244 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2608  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000306401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
301 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
228 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  28.57 
 
 
315 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.11 
 
 
211 aa  58.9  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  30 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
255 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  39.25 
 
 
285 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
204 aa  58.5  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
251 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
252 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 
331 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2413  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00295431  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2590  hypothetical protein  27.89 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
320 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
243 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
239 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  37 
 
 
249 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  32.82 
 
 
311 aa  58.2  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  32.54 
 
 
254 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.15 
 
 
277 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
270 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  34.31 
 
 
257 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>