161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0651 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0651  protein of unknown function DUF150  100 
 
 
169 aa  342  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00506938  normal  0.180527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0139  protein of unknown function DUF150  41.83 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1263  hypothetical protein  36.6 
 
 
155 aa  92.8  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0034  protein of unknown function DUF150  37.9 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.186641  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1213  protein of unknown function DUF150  33.05 
 
 
170 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1628  hypothetical protein  33.99 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3420  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01345  hypothetical protein  36.05 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0253  hypothetical protein  29.79 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0298  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000302311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1781  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000171519  normal  0.0471019 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1307  protein of unknown function DUF150  28.06 
 
 
160 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1151  hypothetical protein  31.15 
 
 
157 aa  60.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962197  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3333  protein of unknown function DUF150  26.05 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.295567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1418  hypothetical protein  40 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710908  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3193  hypothetical protein  29.46 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0250324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2043  hypothetical protein  30.19 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0396  hypothetical protein  26.55 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0150175  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  31.48 
 
 
172 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0367  hypothetical protein  31.96 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000973153  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0400  protein of unknown function DUF150  27.74 
 
 
180 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158996  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1649  hypothetical protein  30.23 
 
 
151 aa  55.5  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296961  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1205  protein of unknown function DUF150  30.47 
 
 
156 aa  54.3  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000854014  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1464  hypothetical protein  34.15 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1583  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.324016  normal  0.240666 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0365  protein of unknown function DUF150  31.18 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00296353  normal  0.904382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1666  protein of unknown function DUF150  30.83 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000315608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14540  hypothetical protein  34.83 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110302  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  31.07 
 
 
152 aa  52  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  30.48 
 
 
151 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1324  hypothetical protein  28.35 
 
 
219 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.777494  normal  0.0380271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3595  protein of unknown function DUF150  27.97 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1058  hypothetical protein  34.15 
 
 
171 aa  51.6  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0222222  normal  0.0438439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1046  hypothetical protein  27.85 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000583244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  41.79 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1367  hypothetical protein  29.81 
 
 
220 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.54901  normal  0.305959 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0922  hypothetical protein  31.97 
 
 
154 aa  50.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000356631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1431  protein of unknown function DUF150  26.23 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000199616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1585  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0279837  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2079  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.727896  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2125  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0426445  normal  0.0108816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2062  hypothetical protein  30 
 
 
192 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4042  hypothetical protein  32.04 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.0029117  normal  0.607114 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3915  hypothetical protein  27.05 
 
 
156 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1518  hypothetical protein  34.57 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.190218  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2311  hypothetical protein  28.79 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0442926  normal  0.0676785 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1066  hypothetical protein  25.95 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000674656  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12857  hypothetical protein  31.16 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000766125  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3968  protein of unknown function DUF150  29.01 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  28.93 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1329  hypothetical protein  27.05 
 
 
156 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000301231  hitchhiker  0.0000903983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7750  protein of unknown function DUF150  27.59 
 
 
203 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3516  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  27.13 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  32.08 
 
 
159 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3864  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000526442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3855  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000468139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3668  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000060287  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3558  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000119608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3576  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000128893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3954  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000590574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3829  hypothetical protein  26.23 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.0936e-62 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2778  hypothetical protein  29.5 
 
 
155 aa  48.5  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000007785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2114  hypothetical protein  29.41 
 
 
166 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.888786  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  28.8 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2469  hypothetical protein  27.05 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000177785  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  30.83 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  30.69 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3639  hypothetical protein  27.05 
 
 
156 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2492  protein of unknown function DUF150  28.18 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1226  hypothetical protein  35.44 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00744714  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  33.33 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  28.8 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  31.88 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0173  hypothetical protein  26.5 
 
 
140 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.961573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3192  hypothetical protein  29.25 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000184124  normal  0.0994389 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1677  hypothetical protein  29.06 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00187557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  35.06 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  29.87 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  29.87 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  29.87 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  29.87 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  27.88 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2150  protein of unknown function DUF150  30.43 
 
 
179 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1413  hypothetical protein  27.83 
 
 
205 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  30.59 
 
 
153 aa  45.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03398  hypothetical protein  29.87 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  28.68 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  31.88 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1712  protein of unknown function DUF150  32.43 
 
 
190 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  31.88 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  31.88 
 
 
169 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1813  protein of unknown function DUF150  31.34 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  normal  0.686814 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08070  hypothetical protein  28.68 
 
 
177 aa  44.3  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0408486  normal  0.217563 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1099  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  27.17 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  27.17 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>