33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3089 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  332  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  47.1 
 
 
271 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  49.62 
 
 
255 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  37.72 
 
 
297 aa  124  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  42.95 
 
 
258 aa  123  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  43.04 
 
 
266 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  46.51 
 
 
258 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  37.58 
 
 
274 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  37.14 
 
 
333 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  43.75 
 
 
275 aa  111  5e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  37.11 
 
 
206 aa  106  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  37.19 
 
 
235 aa  103  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  35.98 
 
 
240 aa  103  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  37.18 
 
 
259 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  38.51 
 
 
239 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  40.15 
 
 
260 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  38.26 
 
 
262 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  40.15 
 
 
258 aa  98.6  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  34.57 
 
 
197 aa  94.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  36.59 
 
 
428 aa  85.9  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  37.4 
 
 
271 aa  85.5  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  33.33 
 
 
403 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  37.96 
 
 
386 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  32.72 
 
 
387 aa  79.3  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  32.21 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  33.07 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  30.22 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 
342 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  28.4 
 
 
312 aa  60.8  0.000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  28.03 
 
 
342 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  30.23 
 
 
340 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  23.78 
 
 
367 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  31.75 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>