30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02570 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  100 
 
 		 406 aa  827    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  52.58 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  49.87 
 
 		 386 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  44.53 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  44.61 
 
 		 387 aa  278  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  42.66 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  33.8 
 
 		 212 aa  116  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  33.02 
 
 		 212 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  30.28 
 
 		 312 aa  107  4e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  33.12 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  30.73 
 
 		 297 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  32.84 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  34.11 
 
 		 258 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  28.24 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.49 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  29.94 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  28.22 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  30.22 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  28.22 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  32.84 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  24.7 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  25.76 
 
 		 271 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  29.34 
 
 		 260 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  29.03 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  26.44 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  25.15 
 
 		 206 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  28.08 
 
 		 262 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  24.47 
 
 		 342 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  32.63 
 
 		 342 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>