42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2883 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
342 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  61.96 
 
 
342 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  42.57 
 
 
168 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  37.66 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  39.72 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  41.26 
 
 
172 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  37.65 
 
 
190 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  36.21 
 
 
239 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  42.74 
 
 
156 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 
340 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  39.6 
 
 
207 aa  102  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  32.74 
 
 
260 aa  100  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  36.69 
 
 
258 aa  99.4  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  43.85 
 
 
168 aa  98.6  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  32.14 
 
 
262 aa  96.3  7e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  32.93 
 
 
197 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  43.85 
 
 
182 aa  96.3  8e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  38.21 
 
 
177 aa  77.4  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  35.4 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  26.92 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  27.95 
 
 
271 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  28.65 
 
 
235 aa  72  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  32.06 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  25 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  27.11 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  30.57 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  24.34 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  30.99 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  26.67 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  34.29 
 
 
165 aa  63.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  31 
 
 
258 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.03 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  24.7 
 
 
240 aa  60.5  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  38.18 
 
 
143 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  26.92 
 
 
312 aa  46.2  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  20.83 
 
 
428 aa  44.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  24.47 
 
 
406 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  27.61 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  27.78 
 
 
386 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  22.75 
 
 
387 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3715  hypothetical protein  42.22 
 
 
146 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  24.18 
 
 
212 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>