33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1210 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  510  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  84.43 
 
 		 258 aa  435  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  42.46 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  41.67 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  35.6 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  37.05 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  34.88 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  32.95 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  33.76 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  32.54 
 
 		 255 aa  145  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  32.01 
 
 		 333 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  43.04 
 
 		 165 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  43.24 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  38.38 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  28.32 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  37.36 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  31.54 
 
 		 240 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  33.76 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  34.46 
 
 		 206 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  33.52 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  34.27 
 
 		 212 aa  90.1  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  31.52 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  30.91 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  29.27 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  27.61 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  29.19 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  25.14 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  26.14 
 
 		 342 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  23.08 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  27.94 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  26.11 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  32.99 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>