32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0411 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  424  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  91.51 
 
 		 212 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  33.98 
 
 		 271 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  34.31 
 
 		 428 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  33.17 
 
 		 403 aa  138  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  33.02 
 
 		 406 aa  128  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  32.69 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  31.37 
 
 		 387 aa  123  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  30.05 
 
 		 386 aa  115  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  31.52 
 
 		 258 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  31.52 
 
 		 259 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  27.32 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  31.65 
 
 		 266 aa  85.5  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  35.43 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  30.18 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  32.56 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  28.88 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  30.36 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  28 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  29.11 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.48 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  25.82 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  26.01 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  30 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  27.65 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  29.01 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  25.56 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  26.57 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  29.37 
 
 		 340 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 		 342 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  27.73 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 		 342 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>