30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1506 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 340 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  40.85 
 
 		 164 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  38.89 
 
 		 190 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  37.41 
 
 		 182 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 		 342 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  36 
 
 		 168 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  24.77 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  30.7 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  40.31 
 
 		 156 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  34.71 
 
 		 207 aa  90.5  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  33.1 
 
 		 164 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  31.91 
 
 		 172 aa  79  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  28.86 
 
 		 167 aa  76.3  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  33.87 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  27.54 
 
 		 168 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  25.88 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  27.87 
 
 		 271 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  24.62 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  24.23 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  24.84 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  29.63 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  29.51 
 
 		 275 aa  54.7  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  30.23 
 
 		 165 aa  51.2  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  27.08 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  29.17 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  25.98 
 
 		 260 aa  46.2  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  26.63 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  30.69 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  30.61 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>