18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22440 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  342  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 
340 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  35.71 
 
 
168 aa  94  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  36.08 
 
 
207 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  36.36 
 
 
182 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  34.04 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  29.86 
 
 
164 aa  73.9  0.0000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  28.93 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  26.21 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  28.1 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  27.11 
 
 
342 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  33.56 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  28.68 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  27.41 
 
 
168 aa  61.2  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
187 aa  50.8  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  29.01 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2026  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3000  metal dependent phosphohydrolase  33.94 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>