18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1901 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  100 
 
 
156 aa  322  9e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  61.59 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  61.07 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  53.46 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  58.65 
 
 
168 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  42.52 
 
 
190 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  42.74 
 
 
342 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  41.94 
 
 
342 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  36.22 
 
 
182 aa  94.4  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  40.57 
 
 
168 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  40.31 
 
 
340 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  37.41 
 
 
207 aa  90.5  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  34.21 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  28.68 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  26.62 
 
 
169 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3312  phosphodiesterase  46.15 
 
 
521 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.924608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3500  phosphodiesterase  46.15 
 
 
521 aa  41.2  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000584399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3371  phosphodiesterase  46.15 
 
 
519 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>