16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0637 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  434  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  46.5 
 
 		 182 aa  140  9e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  51.13 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  42.75 
 
 		 177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  39.13 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  39.6 
 
 		 342 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  36.02 
 
 		 164 aa  94.4  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  36.08 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  36.71 
 
 		 167 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  40.85 
 
 		 342 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  37.41 
 
 		 156 aa  90.5  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  34.71 
 
 		 340 aa  90.5  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  36.96 
 
 		 172 aa  87  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 168 aa  76.3  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  29.71 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2026  metal dependent phosphohydrolase  31.25 
 
 		 172 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>