38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0275 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  100 
 
 
172 aa  356  9.999999999999999e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  64 
 
 
168 aa  205  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  54.37 
 
 
167 aa  175  3e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  58.16 
 
 
164 aa  174  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  53.46 
 
 
156 aa  161  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  40.88 
 
 
190 aa  120  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  42.55 
 
 
342 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  41.26 
 
 
342 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  37.61 
 
 
182 aa  92  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  36.75 
 
 
168 aa  89  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  36.96 
 
 
207 aa  87  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  31.91 
 
 
340 aa  79  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  26.21 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  31.85 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  30.88 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  31.06 
 
 
169 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1617  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  39.13 
 
 
510 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000205751  hitchhiker  0.00000000000531756 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1372  phosphodiesterase  37.68 
 
 
519 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800868  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1262  RNA binding metal dependent phosphohydrolase  38.71 
 
 
509 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1346  phosphodiesterase  37.68 
 
 
519 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.66517  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1644  phosphodiesterase  39.71 
 
 
511 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1926  phosphodiesterase  39.71 
 
 
511 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11870  metal dependent phosphohydrolase  32.17 
 
 
514 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000537836  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1337  phosphodiesterase  29.71 
 
 
540 aa  41.6  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1422  phosphodiesterase  36.76 
 
 
521 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.008621  normal  0.971465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3813  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0688282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3627  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3519  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07460  metal dependent phosphohydrolase  26.19 
 
 
525 aa  41.2  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00487641  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3537  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.311927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3914  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00777631  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0853  phosphodiesterase  37.68 
 
 
519 aa  40.8  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.726014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3877  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1625  phosphodiesterase  40 
 
 
508 aa  40.8  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00284901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3549  phosphodiesterase  36.76 
 
 
521 aa  40.8  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000213332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2430  phosphodiesterase  36.76 
 
 
520 aa  40.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1191  phosphodiesterase  39.34 
 
 
518 aa  40.8  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000197151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3825  phosphodiesterase  36.76 
 
 
521 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>