18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0181 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  88.1 
 
 
182 aa  321  3e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  51.13 
 
 
207 aa  140  8e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  49.19 
 
 
177 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2008  HD family hydrolase  40 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000958084  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  36 
 
 
340 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  43.85 
 
 
342 aa  98.6  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0295  HD superfamily hydrolase  32.26 
 
 
164 aa  94.4  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.232447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  35.71 
 
 
164 aa  94  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1901  HD superfamily hydrolase  40.57 
 
 
156 aa  92.4  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0275  HD superfamily hydrolase  36.75 
 
 
172 aa  89  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  43.97 
 
 
342 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1605  hypothetical protein  33.07 
 
 
167 aa  88.6  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000432675  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1220  metal dependent phosphohydrolase  37.84 
 
 
168 aa  75.9  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000103301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  31.43 
 
 
169 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2026  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
187 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3000  metal dependent phosphohydrolase  30.71 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.24311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>