18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2026 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2026  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3000  metal dependent phosphohydrolase  92.35 
 
 		 172 aa  291  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4362  metal dependent phosphohydrolase  60.54 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0748  metal dependent phosphohydrolase  63.95 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.663055  normal  0.257153 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0181  hypothetical protein  30.71 
 
 		 168 aa  47.8  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0583  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.07 
 
 		 704 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.496315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4348  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.43 
 
 		 728 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314297  hitchhiker  0.00562302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2586  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.37 
 
 		 727 aa  44.7  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.577877  normal  0.134975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1239  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.09 
 
 		 760 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1526  hypothetical protein  29.13 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0431553  normal  0.0979623 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1162  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.031643  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0804  hD superfamily hydrolase  26.51 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.644869  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0538  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  30.77 
 
 		 727 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.533831  normal  0.300886 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1221  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  31.11 
 
 		 822 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  28.47 
 
 		 679 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22440  hypothetical protein  33.94 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0637  hypothetical protein  31.25 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.323519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1138  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  43.4 
 
 		 699 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>