33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0197 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 		 271 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  43.67 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  39.62 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  42.45 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  36.96 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  34.38 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  31.62 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  34.02 
 
 		 262 aa  142  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  31.38 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  31.54 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  32.67 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  41.76 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  34.92 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  35.62 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  47.1 
 
 		 165 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  32.31 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  30.31 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  36.03 
 
 		 206 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  28.99 
 
 		 240 aa  106  5e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  29.09 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  29.52 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  32.82 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  28.48 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  30.35 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  32.85 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  27.5 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  30.77 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  26.88 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  25.76 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  26.52 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  24.31 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  25.19 
 
 		 312 aa  48.9  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  29.37 
 
 		 136 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>