32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0483 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  39.62 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  38.46 
 
 
258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  40.78 
 
 
258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  31.78 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  31.3 
 
 
297 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  31.8 
 
 
260 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  43.04 
 
 
165 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  30.47 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  26.23 
 
 
255 aa  115  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  27.13 
 
 
275 aa  112  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  39.75 
 
 
197 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  30.94 
 
 
333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  37.01 
 
 
262 aa  108  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  37.14 
 
 
239 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  28.4 
 
 
240 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  32.05 
 
 
235 aa  99.4  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  40.15 
 
 
206 aa  99  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  42.96 
 
 
259 aa  98.6  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  29.82 
 
 
271 aa  82  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  30.25 
 
 
212 aa  77  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  29.11 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  30 
 
 
428 aa  75.5  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  30.38 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  32.84 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  29.24 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  30.82 
 
 
342 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  31.45 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  30.57 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  24.23 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  23.35 
 
 
367 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  31.68 
 
 
136 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>