34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1800 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  38.87 
 
 
258 aa  194  9e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  35.48 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  35.08 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  34.14 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  36.96 
 
 
271 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  33.72 
 
 
262 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  31.9 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  32.64 
 
 
255 aa  135  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  33.62 
 
 
239 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  32.23 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  30.37 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  31.8 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  29.49 
 
 
235 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  37.42 
 
 
197 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  28.24 
 
 
297 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  41.79 
 
 
165 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  40.16 
 
 
206 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  33.18 
 
 
342 aa  98.2  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.63 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  43.14 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  26.37 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  27.54 
 
 
403 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  28.14 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  28.74 
 
 
406 aa  66.2  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  26.95 
 
 
271 aa  65.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  28.19 
 
 
428 aa  63.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  24.86 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  24.85 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  29.01 
 
 
386 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  25.98 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  29.32 
 
 
136 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  26.67 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  34.02 
 
 
143 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>