30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1560 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 		 271 aa  556  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  44.49 
 
 		 403 aa  202  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  45.02 
 
 		 387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  42.41 
 
 		 428 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  42.66 
 
 		 406 aa  187  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  39.74 
 
 		 386 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  32.89 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  33.66 
 
 		 212 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  33.98 
 
 		 212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  37.4 
 
 		 165 aa  85.5  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  29.82 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  32.12 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  26.23 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  24.86 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  27.88 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  23.2 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  32.85 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  25 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  34.57 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  29.17 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  26.82 
 
 		 333 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  28.47 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  30.08 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  26.67 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  27.22 
 
 		 197 aa  55.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  26.56 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  27.91 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  26.63 
 
 		 340 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 		 342 aa  42  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>