32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1577 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 
258 aa  519  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  38.46 
 
 
260 aa  186  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  35.74 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  32.2 
 
 
274 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  34.55 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  31.62 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  34.2 
 
 
333 aa  125  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  32.07 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  32.65 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  26.07 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  29.46 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  40.85 
 
 
197 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  30.47 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  36.69 
 
 
342 aa  99.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.97 
 
 
275 aa  98.6  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  40.15 
 
 
165 aa  98.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  29 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  41.74 
 
 
342 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  38.89 
 
 
206 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  26.34 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  27.88 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  28 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  29.22 
 
 
212 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  24.7 
 
 
406 aa  62.4  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  30.58 
 
 
386 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  25 
 
 
387 aa  57  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  24.84 
 
 
403 aa  56.6  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  30.21 
 
 
428 aa  56.2  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  28.71 
 
 
312 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  25.48 
 
 
367 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3201  hypothetical protein  41.3 
 
 
143 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>