27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0914 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 		 312 aa  640    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  32.89 
 
 		 271 aa  135  8e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  34.76 
 
 		 403 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  33.98 
 
 		 428 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  30.09 
 
 		 387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  32.54 
 
 		 212 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  32.68 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  30.28 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  32.85 
 
 		 386 aa  97.4  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  31.58 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  30.23 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  27.91 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  28.4 
 
 		 165 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  25.66 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  26.67 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  26.95 
 
 		 260 aa  57  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  24.4 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  38.81 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  30.93 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  28.71 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  25.19 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  25.84 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  28.08 
 
 		 197 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  23.31 
 
 		 206 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  29.29 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.43 
 
 		 275 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>