32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1527 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_1527  permease  100 
 
 
262 aa  531  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  32.56 
 
 
258 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  32.56 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  34.02 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  35.71 
 
 
333 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  32.94 
 
 
258 aa  139  6e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  32.5 
 
 
255 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  32.37 
 
 
259 aa  125  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  31.3 
 
 
240 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  30.29 
 
 
235 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  29.92 
 
 
274 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  33.33 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  35.2 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  29 
 
 
258 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  37.78 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
342 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  37.35 
 
 
275 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  27.15 
 
 
297 aa  103  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  36.2 
 
 
165 aa  102  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  33.81 
 
 
342 aa  102  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  32.95 
 
 
206 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  26.7 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  23.6 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  25.73 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  30.14 
 
 
403 aa  59.3  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  25.73 
 
 
428 aa  57.8  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  25 
 
 
387 aa  57.4  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  28.08 
 
 
406 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  26.49 
 
 
367 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  27.06 
 
 
386 aa  50.4  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  24.03 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1443  hypothetical protein  26.04 
 
 
200 aa  43.1  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.565144 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>