15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1444 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  749    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1443  hypothetical protein  44.32 
 
 
200 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224463  normal  0.565144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  23.73 
 
 
271 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  24.18 
 
 
206 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  23.35 
 
 
266 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  21.2 
 
 
239 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  26.32 
 
 
262 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  23.78 
 
 
165 aa  50.4  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  25.48 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  24.43 
 
 
275 aa  47  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  23.27 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  30.26 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  27.93 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  25.42 
 
 
258 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  21.47 
 
 
274 aa  43.1  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>