33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1797 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1797  protein of unknown function DUF1113  100 
 
 
274 aa  553  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00189762  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1813  hypothetical protein  34.23 
 
 
259 aa  181  1e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.406185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1548  hypothetical protein  34.09 
 
 
240 aa  168  8e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000391907  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1643  hypothetical protein  36.51 
 
 
235 aa  165  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1398  hypothetical protein  37.07 
 
 
258 aa  149  6e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0197  protein of unknown function DUF1113  34.38 
 
 
271 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1800  hypothetical protein  34.14 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1577  protein of unknown function DUF1113  32.2 
 
 
258 aa  137  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000270408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1210  hypothetical protein  36.08 
 
 
258 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000120953  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0483  hypothetical protein  31.78 
 
 
266 aa  130  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00123635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1052  hypothetical protein  31.44 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000029525  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0803  hypothetical protein  28.74 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3089  hypothetical protein  37.58 
 
 
165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000614465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22430  predicted membrane protein  28.03 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1527  permease  30.19 
 
 
262 aa  112  9e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0030296  normal  0.070351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2007  protein of unknown function DUF1113  32.57 
 
 
239 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000472326  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1851  hypothetical protein  34.48 
 
 
197 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0636  protein of unknown function DUF1113  28.35 
 
 
275 aa  108  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.405104  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2308  protein of unknown function DUF1113  37.31 
 
 
206 aa  93.2  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1156  protein of unknown function DUF1113  30 
 
 
403 aa  85.5  8e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.703838  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10080  predicted membrane protein  28.64 
 
 
387 aa  84  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00521353  hitchhiker  0.00000136128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1245  hypothetical protein  28.87 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0415  hypothetical protein  30.27 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1560  protein of unknown function DUF1113  25 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150594  normal  0.0147317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02570  predicted membrane protein  29.94 
 
 
406 aa  68.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.287221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0411  hypothetical protein  28.88 
 
 
212 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2883  metal dependent phosphohydrolase  25 
 
 
342 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0914  protein of unknown function DUF1113  30.23 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.592776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0966  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 
342 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.058777  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1696  protein of unknown function DUF1113  28.12 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.176656  normal  0.89414 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1506  metal dependent phosphohydrolase  24.84 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05240  hypothetical protein  31.4 
 
 
136 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1444  hypothetical protein  21.47 
 
 
367 aa  42.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.06251  normal  0.227287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>